По мнению заявителя, указанные положения Налогового кодекса РФ не позволяют плательщикам НДС по истечении трех лет после окончания соответствующего налогового периода реализовать право на возмещение из бюджета сумм превышения налоговых вычетов над суммой исчисленного налога. Суд указал, что сами по себе положения названной нормы являются частью механизма правового регулирования отношений по взиманию НДС и ставят налогоплательщиков в равные условия с точки зрения исполнения обязанности по уплате налога, а потому их нельзя признать нарушающими конституционные права. Что касается проверки законности и обоснованности вынесенных арбитражными судами по делу с участием заявителя судебных актов, в которых, по его мнению, не учтены уважительные причины пропуска им срока, предусмотренного для предоставления документов, подтверждающих право на заявленные налоговые вычеты, то разрешение таких вопросов к полномочиям Конституционного суда РФ, не относится.

(Определение КС РФ от 03.07.08 №630-О-П).

В соответствии с п. 2 ст. 171 НК РФ вычетам подлежат суммы налога на добавленную стоимость, предъявленные налогоплательщику при приобретении товаров (работ, услуг) на территории РФ в отношении товаров (работ, услуг), приобретенных для осуществления операций, облагаемых налогом на добавленную стоимость.

Согласно пп. 12 п. 2 ст. 149 НК РФ реализация ценных бумаг не подлежит налогообложению налогом на добавленную стоимость. По мнению Минфина РФ, услуги по ведению реестра ценных бумаг приобретаются в связи с осуществлением данных операций. Таким образом, суммы налога на добавленную стоимость, предъявленные по указанным услугам, к вычету приниматься не должны.

Что касается услуг, приобретенных с целью проведения собрания акционеров, то данные услуги с осуществлением каких-либо операций, облагаемых налогом на добавленную стоимость, не связаны. Поэтому суммы налога по таким услугам к вычету также не принимаются.

(Письмо Минфина РФ от 29.01.09 №03-07-07/03).

При приобретении работником электронного билета для поездок в командировки на территории Российской Федерации и за рубеж документами, подтверждающими произведенные расходы, могут являться маршрут/квитанция, оформленная на утвержденном в качестве бланка строгой отчетности пассажирском билете, чек или другой документ, подтверждающий произведенную оплату перевозки, оформленный на утвержденном бланке строгой отчетности.

Вместе с тем, по мнению Минфина РФ, расходы при приобретении работником электронного авиа- или железнодорожного билета также могут быть приняты в уменьшение налоговой базы по налогу на прибыль, если данные расходы имеют косвенное подтверждение, то есть, в частности, при наличии документов, подтверждающих направление сотрудника в командировку, проживание за границей, и иных оправдательных документов, оформленных унифицированными формами первичной учетной документации и удостоверяющих факт пребывания работника в командировке, и распечатки электронного билета или посадочного талона с указанием реквизитов, позволяющих идентифицировать проезд работника в командировку (в частности, фамилия пассажира, маршрут, стоимость билета, дата поездки).

Расходы на модернизацию основных средств первоначальной стоимостью менее 20 000 руб., стоимость которых списана для целей налогообложения единовременно в составе материальных расходов, также подлежат включению в состав текущих расходов налогового (отчетного) периода. Экономически обоснованные и документально подтвержденные расходы на модернизацию (реконструкцию, техническое перевооружение) такого имущества, могут быть в полном объеме учтены для целей налогообложения прибыли в составе прочих расходов, связанных с производством и реализацией.

(Письмо Минфина РФ от 15.01.09 №03-03-06/1/16).

Приказом Минэкономразвития России от 12.11.2008 №395 "Об установлении коэффициента-дефлятора в целях применения главы 26.2 Налогового кодекса Российской Федерации "Упрощенная система налогообложения" на 2008 год" коэффициент-дефлятор на 2009 г. определен в размере 1,538.

В связи с вышеизложенным в 2009 г. величина предельного размера доходов по итогам 9 месяцев 2009 г., ограничивающая право перехода организаций на упрощенную систему налогообложения с 1 января 2010 г., равна 23 070 тыс. руб. (15 млн руб. x 1,538), величина предельного размера доходов налогоплательщика, ограничивающая право на применение упрощенной системы налогообложения по итогам отчетного (налогового) периода в 2009 г., равна 30 760 тыс. руб. (20 млн руб. x 1,538).

Внесение изменений в гл. 26.2 Кодекса, предусматривающих увеличение предельного размера доходов налогоплательщиков в целях применения упрощенной системы налогообложения сверх вышеуказанных значений, не планируется.